MLflow 跟踪的自动日志记录
自动日志记录是一项强大的功能,它允许您在无需显式日志语句的情况下记录指标、参数和模型。您需要做的就是在训练代码之前调用 mlflow.autolog()。
import mlflow
mlflow.autolog()
with mlflow.start_run():
# your training code goes here
...
这将使 MLflow 能够自动记录运行的各种信息,包括
- 指标 - MLflow 根据您使用的模型和库预先选择要记录的一组指标
- 参数 - 训练指定的超参数,以及库提供的默认值(如果未显式设置)
- 模型签名 - 记录 模型签名 实例,该实例描述了模型的输入和输出模式
- 构件 - 例如模型检查点
- 数据集 - 用于训练的数据集对象(如果适用),例如 tensorflow.data.Dataset
入门指南
步骤 1 - 获取 MLflow
MLflow 在 PyPI 上可用。如果您尚未在系统上安装它,可以使用以下命令进行安装:
pip install mlflow
步骤 2 - 在代码中插入 mlflow.autolog
例如,以下代码片段展示了如何为 scikit-learn 模型启用自动日志记录
import mlflow
from sklearn.model_selection import train_test_split
from sklearn.datasets import load_diabetes
from sklearn.ensemble import RandomForestRegressor
mlflow.autolog()
db = load_diabetes()
X_train, X_test, y_train, y_test = train_test_split(db.data, db.target)
rf = RandomForestRegressor(n_estimators=100, max_depth=6, max_features=3)
# MLflow triggers logging automatically upon model fitting
rf.fit(X_train, y_train)
步骤 3 - 执行您的代码
python YOUR_ML_CODE.py
步骤 4 - 在 MLflow UI 中查看您的结果
训练作业完成后,您可以运行以下命令启动 MLflow UI
mlflow server --port 8080
然后,在浏览器中导航到 https://:8080 查看结果。
自定义自动日志记录行为
您还可以通过向 mlflow.autolog() 函数传递参数来控制自动日志记录的行为。例如,您可以禁用模型检查点的日志记录,并将标签与您的运行相关联,如下所示
import mlflow
mlflow.autolog(
log_model_signatures=False,
extra_tags={"YOUR_TAG": "VALUE"},
)
请参阅 mlflow.autolog() 以获取可用的完整参数集。
为特定库启用/禁用自动日志记录
一种常见的用例是为特定库启用/禁用自动日志记录。例如,如果您在 PyTorch 上训练模型,但使用 scikit-learn 进行数据预处理,您可能希望为 scikit-learn 禁用自动日志记录,同时为 PyTorch 启用它。您可以通过以下方式实现此目的:(1) 使用 PyTorch 插件仅为 PyTorch 启用自动日志记录 (2) 使用 scikit-learn 插件并设置 disable=True 来为 scikit-learn 禁用自动日志记录。
import mlflow
# Option 1: Enable autologging only for PyTorch
mlflow.pytorch.autolog()
# Option 2: Disable autologging for scikit-learn, but enable it for other libraries
mlflow.sklearn.autolog(disable=True)
mlflow.autolog()
支持的库
通用的自动日志记录函数 mlflow.autolog() 会在您安装的每个支持的库被导入后立即为其启用自动日志记录。或者,您可以使用特定于库的自动日志记录调用,例如 mlflow.pytorch.autolog() 来显式启用(或禁用)特定库的自动日志记录。
以下列表涵盖了 MLflow 中支持自动日志记录的最流行的库
还有许多其他集成支持自动日志记录,并且支持的库列表正在不断增长。请参阅专门页面,以获取有关特定库是否支持自动日志记录的进一步指导。
对于自动将模型保存为构件的插件,会记录用于依赖项管理的其他文件。
Keras/TensorFlow
在训练代码之前调用通用的自动日志记录函数或 mlflow.tensorflow.autolog() 来启用指标和参数的自动日志记录。例如,尝试运行 Keras/Tensorflow 示例。
请注意,仅支持 tensorflow>=2.3 的版本。tf.estimator 和 EarlyStopping 的相关指标会自动记录。例如,尝试运行 Keras/TensorFlow 示例。
自动日志记录捕获以下信息
| 框架 | 指标 | 参数 | 标签 | 工件 |
|---|---|---|---|---|
tf.keras | 训练损失;验证损失;用户指定的指标 | fit() 参数;优化器名称;学习率;epsilon | -- | 训练开始时的模型摘要;MLflow 模型(Keras 模型);训练结束时的 TensorBoard 日志 |
tf.keras.callbacks.EarlyStopping | 来自 EarlyStopping 回调的指标。例如,stopped_epoch、restored_epoch、restore_best_weight 等 | 来自 EarlyStopping 的 fit() 参数。例如,min_delta、patience、baseline、restore_best_weights 等 | -- | -- |
如果 autolog() 捕获数据时没有活动的运行,MLflow 将自动创建一个运行来记录信息。此外,MLflow 将在训练结束时通过调用 tf.keras.fit() 自动结束该运行。
如果 autolog() 捕获数据时已存在运行,MLflow 将记录到该运行,但不会在训练后自动结束该运行。如果您想开始一个新的运行上下文以记录到新的运行,则必须手动停止运行。
LightGBM
在训练代码之前调用通用的自动日志记录函数 mlflow.lightgbm.autolog() 来启用指标和参数的自动日志记录。
自动日志记录捕获以下信息
| 框架 | 指标 | 参数 | 标签 | 工件 |
|---|---|---|---|---|
| LightGBM | 用户指定的指标 | lightgbm.train 参数 | -- | 训练结束时的MLflow 模型(LightGBM 模型)以及模型签名、特征重要性、输入示例; |
如果启用了早停,将作为额外步骤/迭代记录最佳迭代时的指标。
Paddle
在训练代码之前调用通用的自动日志记录函数 mlflow.paddle.autolog() 来启用指标和参数的自动日志记录。
自动日志记录捕获以下信息
| 框架 | 指标 | 参数 | 标签 | 工件 |
|---|---|---|---|---|
| Paddle | 用户指定的指标 | paddle.Model.fit 参数 | -- | 训练结束时的MLflow 模型(Paddle 模型)以及模型签名 |
PySpark
在训练代码之前调用 mlflow.pyspark.ml.autolog() 来启用指标、参数和模型的自动日志记录。请参阅 PySpark 的示例用法。
pyspark ml 估计器的自动日志记录捕获以下信息
| 指标 | 参数 | 标签 | 工件 |
|---|---|---|---|
通过 Evaluator.evaluate 获得的训练后指标 | 通过 Estimator.fit 获得的参数 |
|
|
PyTorch
在 PyTorch Lightning 训练代码之前调用通用的自动日志记录函数 mlflow.pytorch.autolog() 来启用指标、参数和模型的自动日志记录。请参阅此处的示例用法。请注意,目前 PyTorch 自动日志记录仅支持使用 PyTorch Lightning 训练的模型。
自动日志记录在调用 pytorch_lightning.trainer.Trainer.fit 时触发,并捕获以下信息
| 框架/模块 | 指标 | 参数 | 标签 | 工件 |
|---|---|---|---|---|
pytorch_lightning.trainer.Trainer | 训练损失;验证损失;平均测试准确率;用户定义的指标 | fit() 参数;优化器名称;学习率;epsilon。 | -- | 训练开始时的模型摘要,训练结束时的MLflow 模型(PyTorch 模型); |
pytorch_lightning.callbacks.earlystopping | 训练损失;验证损失;平均测试准确率;用户定义的指标。来自 EarlyStopping 回调的指标。例如,spotted_epoch、restored_epoch、restore_best_weight 等 | fit() 参数;优化器名称;学习率;epsilon。来自 EarlyStopping 回调的参数。例如,min_delta、patience、baseline、restore_best_weights 等 | -- | 训练开始时的模型摘要;训练结束时的MLflow 模型(PyTorch 模型);如果训练因早停回调而停止,则最佳 PyTorch 模型检查点。 |
如果 autolog() 捕获数据时没有活动的运行,MLflow 将自动创建一个运行来记录信息,并在调用 pytorch_lightning.trainer.Trainer.fit() 完成后结束该运行。
如果 autolog() 捕获数据时已存在运行,MLflow 将记录到该运行,但不会在训练后自动结束该运行。
- 使用
pytorch_lightning.trainer.Trainer.fit()时,用户未显式传递的参数(使用默认值的参数)目前不会自动记录 - 在多优化器场景(例如自编码器)中,仅记录第一个优化器的参数
Scikit-learn
在训练代码之前调用 mlflow.sklearn.autolog() 来启用 sklearn 指标、参数和模型的自动日志记录。请参阅此处的示例用法。
对于估计器(例如 LinearRegression)和元估计器(例如 Pipeline)的自动日志记录会创建一个单独的运行并记录
| 指标 | 参数 | 标签 | 工件 |
|---|---|---|---|
通过 estimator.score 获得的训练分数 | 通过 estimator.get_params 获得的参数 |
| 已拟合的估计器 |
对于参数搜索估计器(例如 GridSearchCV)的自动日志记录会创建一个单独的父运行和嵌套的子运行
- Parent run
- Child run 1
- Child run 2
- ...
包含以下数据
| 运行类型 | 指标 | 参数 | 标签 | 工件 |
|---|---|---|---|---|
| 父级 | 训练分数 |
|
|
|
| 子级 | 每个参数组合的 CV 测试分数 | 每个参数组合 |
| -- |
Spark
初始化一个 SparkSession 并附加 mlflow-spark JAR(例如,SparkSession.builder.config("spark.jars.packages", "org.mlflow.mlflow-spark")),然后调用通用的自动日志记录函数 mlflow.spark.autolog() 来在读取时启用 Spark 数据源信息的自动日志记录,无需显式日志语句。请注意,Spark ML (MLlib) 模型的自动日志记录尚不支持。
自动日志记录捕获以下信息
| 框架 | 指标 | 参数 | 标签 | 工件 |
|---|---|---|---|---|
| Spark | -- | -- | 包含源路径、版本、格式的单个标签。标签包含每行一个数据源 | -- |
- 此外,Spark 数据源的自动日志记录是异步进行的——因此,在启动短暂的 MLflow 运行时可能会(尽管不太可能)出现竞态条件,导致数据源信息未被记录。
对于 Pyspark 3.2.0 或更高版本,Spark 数据源的自动日志记录需要将 PYSPARK_PIN_THREAD 环境变量设置为 false。
Statsmodels
在训练代码之前调用通用的自动日志记录函数 mlflow.statsmodels.autolog() 来启用指标和参数的自动日志记录。
自动日志记录捕获以下信息
| 框架 | 指标 | 参数 | 标签 | 工件 |
|---|---|---|---|---|
| Statsmodels | 用户指定的指标 | statsmodels.base.model.Model.fit 参数 | -- | 训练结束时的MLflow 模型(statsmodels.base.wrapper.ResultsWrapper) |
- 每个覆盖 fit 的模型子类都会期望并记录其自身的参数。
XGBoost
在训练代码之前调用通用的自动日志记录函数 mlflow.xgboost.autolog() 来启用指标和参数的自动日志记录。
自动日志记录捕获以下信息
| 框架 | 指标 | 参数 | 标签 | 工件 |
|---|---|---|---|---|
| XGBoost | 用户指定的指标 | xgboost.train 参数 | -- | 训练结束时的MLflow 模型(XGBoost 模型)以及模型签名、特征重要性、输入示例 |
如果启用了早停,将作为额外步骤/迭代记录最佳迭代时的指标。